上海市植物学会成立于1949年10月，是由植物科学技术工作者自愿组成的学术性的非营利性社会团体法人。本会的宗旨为组织和团结全市广大植物科技教育工作者，遵守国家的法律、法规和政策，遵守社会道德风尚，坚持科学发展观，致力于科技创新、保护和发展地区植物资源，吸收国内外先进技术，建设生态文明。在本学科领域中进行专题科研、学术讨论研究、科普教育、科技咨询培训等，更好地为上海市植物事业作出贡献。

学会的主要任务包括，积极开展学术交流，组织专题学术探讨、开展科学研究，出版学术及科普刊物。针对党和国家及上海重大科学技术问题，从植物学角度提供咨询，发动会员积极地提出合理化建议。积极开展国内学术交流，密切与兄弟省市的联系，促进国外植物科学团体和学者间的交流。宣传普及科学的理论和知识，传播先进的科学技术经验，举办科普报告会、讨论会等。适应学科发展和建设需要，以及会员的要求，举办多种形式的培训班、讲习班，努力提高植物学科技教育工作者的学术水平。及时向党和政府部门，反映植物学科技教育工作者的意见和呼声。

上海市植物学会自2005年起每年举办青年论文报告会，至今已连续举办13届，设立上海市青少年科技创新辅导站，积极为上海市的建设发展出谋划策，承接完成上海市科委及科协项目多项。